マクマーフィーは未成年の少女を強姦した疑いで逮捕・刑務所に入れられる予定であった。しかし、刑務所に入りたくなかったマクマーフィーは精神異常者のふりをして人里離れた精神病院へ入院することに成功する。 この施設には、体はでかいが言葉がはなせないチーフ、明るく悪ノリのできるビリーなどちょっとおかしな患者がたくさんいる。彼らはこの施設の中で決められた時間に起き、決められた薬を看護師の前で飲み、施設内でおとなしく生活している。 そんな彼らをみて、マクマーフィーは「もっと楽しいことをしよう」とみんなを誘い出す。テレビを見たいと言ったり、バスケットボールを始めたり、挙句のはてに病院内へ女の子を連れ込んでしまう。さらに、雰囲気が良くなったビリーと女の子をくっつけるために２人きりにしたマクマーフィーであったが、その行為が婦長に知られてビリーが処罰を受けることになる。 異常なまでに恐怖に怯えるビリーは自殺をしてしまう。激怒するマクマーフィー。婦長に対して、マクマーフィーとビリーの運命はいかに。